电视剧《第十二秒》的结局是许菡死在了曾景元的枪下，曾景元锒铛入狱，起亦晨带着女儿开始了新的生活。
曾景元意识到自己被骗了恼羞成怒，对许菡威逼利诱，许菡面对曾景元的恐吓不为所惧。最终，许菡在曾景元的威胁下，只能先启动汽车冲出警察的包围圈，趁机猛打方向盘将车撞向树干，不等曾景元有所反应便跳车而逃。曾景元开枪杀死了许菡，许菡倒在了赵亦晨的怀里。
后来，杨骞被判处死刑，乘风破浪集团没收非法所得，曾景元，张自来和冯彬等人最终都被绳之以法。刘磊也走出了校园霸凌的阴影，赵亦晨带着女儿为刘磊加油。赵亦晨带着鲜花祭拜妻子。一切都已尘埃落定。